CIFOR-ICRAF lleva trabajando en Brasil desde 2004, forjando asociaciones estratégicas destinadas a crear conocimientos científicos sobre los bosques, el uso sostenible de la tierra y soluciones agroforestales adaptadas a diferentes contextos.

La investigación se ha centrado en la restauración del paisaje forestal, los sistemas y la mitigación del cambio climático y la adaptación al mismo, principalmente en los biomas de la Amazonia, el Cerrado y la Mata Atlántica. Otras áreas de investigación son: REDD+, género, promoción de sistemas agroforestales, procesos de co-aprendizaje para la inclusión de la agroforestería con cultivos clave, co-diseño de sistemas agroforestales, árboles en fincas para la biodiversidad, y sistemas agroforestales biodiversos y sucesionales.